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MIMIC-IV数据集解析及数据样例

MIMIC-IV (Medical Information Mart for Intensive Care IV)由麻省理工学院计算生理学实验室构建。它是一个大型、免费的数据集,由30万左右病人的健康数据信息构成。这些病人来自Beth Israel Deaconess Medical Center的ICU,时间为2009年至2019年。

 

该数据集主要包括了人口统计数据(demographics)、在病床进行的生命体征测量、实验室检查结果、治疗(procedures)、药物、护理人员工作记录、影像报告、死亡信息等信息。

 

该数据集可用于支持广泛的研究工作,包括流行病学、临床决策规则优化、医疗电子工具开发。它具有三个显著的优点:可供全世界研究者广泛使用;涵盖多元化且数据庞大的ICU患者群体;包括大量的时序数据,包括实验室检查结果、电子文档、临床监测数据。

 

该数据集共包括31张表格,分别如下:
字典信息数据表:
1. d_labitems
2. d_icd_procedures
3. d_icd_diagnoses
4. d_hcpcs(MIMIC-IV新表)
5. d_items
患者人口学信息及院内周转信息表
1. admissions
2. provider(MIMIC-IV新表)
3. icustays
4. patients
5. services
6. transfers
患者在住院期间采集的各类信息表
1. ingredientevents(MIMIC-IV新表)
2. chartevents
3. datetimeevents
4. inputevents
5. caregiver
6. omr(MIMIC-IV新表)
7. outputevents
8. procedureevents

 

医院记录系统采集的各类信息表
1. diagnoses_icd
2. drgcodes
3. labevents
4. microbiologyevents
5. prescriptions
6. procedures_icd
7. poe(MIMIC-IV新表)
8. poe_detail(MIMIC-IV新表)
9. pharmacy(MIMIC-IV新表)
10. emar
11. emar_detail
12. hcpcsevents(MIMIC-IV新表)

一、 数据表结构解析

(一)字典信息数据表

1. d_labitems
官方说明地址:
https://mimic.mit.edu/docs/iv/modules/hosp/d_labitems/
表来源:医院数据库
表内容:实验室检查项目(Dimension table for labevents provides a description of all lab items.)
表行数:1,622
表间联系:通过itemid 与labevents 表相关
 

2. d_icd_procedures
官方说明地址:
https://mimic.mit.edu/docs/iv/modules/hosp/d_icd_procedures/
表来源:医院数据库
表内容:国际疾病分类(ICD)措施数据(Dimension table for procedures_icd; provides a description of ICD-9/ICD-10 billed procedures.)
表行数:85,257
表间联系:通过icd_code和icd_version 与procedures_icd 表相关
3. d_icd_diagnoses
官方说明地址:
https://mimic.mit.edu/docs/iv/modules/hosp/d_icd_diagnoses/
表来源:医院数据库
表内容:国际疾病分类 (ICD) 9/10 版诊断信息(Dimension table for diagnoses_icd; provides a description of ICD-9/ICD-10 billed diagnoses.)
表行数:109,775
表间联系:通过icd_code和icd_version 与diagnoses_icd 表相关
4. d_hcpcs (MIMIC-IV 新数据表)
官方说明地址:
https://mimic.mit.edu/docs/iv/modules/hosp/d_hcpcs/
表来源:医院数据库
表内容:为 hcpcsevents 表中使用的代码提供易于理解的定义(Dimension table for hcpcsevents; provides a description of CPT codes.)
表行数:89,200
表间联系:通过code 与hcpcsevents表相关
5. d_items
官方说明地址:
https://mimic.mit.edu/docs/iv/modules/icu/d_items/
表来源:医院ICU数据库
表内容:ICU数据库中所有items的定义表(Dimension table describing itemid. Defines concepts recorded in the events table in the ICU module)
表行数:4,014
表间联系:通过itemid与chartevents表相关,通过itemid与datetimeevents表相关,通过itemid与inputevents表相关,通过itemid与outputevents表相关,通过itemid与procedureevents表相关
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