发布于 2024-04-18 16:00:15

MIMIC数据库，如何统计特定年龄以上具有两个特定icd代码的患者记录数？

注意是：具有两个特定icd代码（即两种疾病）

上篇文章我们讲了MIMIC数据库，如何统计特定icd代码超过特定年龄的患者住院记录数？

这里很类似，不同的是需要查询两个特定icd代码（即两种疾病）

其实前面都一样，不同的是我们需要再增加一个子查询（虚拟表）

-- Count the number of patients with two specific icd9 codes above a certain age
-- 统计特定年龄以上具有两个特定icd代码的患者记录数
WITH agetbl AS 
	(
	SELECT ad.subject_id,
	-- 患者表中记录的是年龄是脱敏数据，是一个相对年龄，必须经过转换才可得出患者的真实年龄
    -- 年龄计算公式为 患者相对年龄+患者入院时间年份-偏移年份
    MAX(ROUND(p.anchor_age + mimiciv_derived.DATETIME_DIFF(ad.admittime, 
    mimiciv_derived.DATETIME(p.anchor_year, 1, 1, 0, 0, 0), 'YEAR'),2)) AS age 
	FROM mimiciv_hosp.admissions ad 
	INNER JOIN mimiciv_hosp.patients p 
	ON ad.subject_id = p.subject_id 
	GROUP BY ad.subject_id
	), tbl01 as (
SELECT dia.subject_id, age

from mimiciv_hosp.diagnoses_icd dia

INNER JOIN agetbl dt ON dia.subject_id = dt.subject_id

WHERE dia.icd_code

-- 278% relates to obesity 与肥胖症相关

LIKE '278%'

AND age > 40

GROUP BY dia.subject_id, dt.age)
SELECT dib.subject_id, COUNT(DISTINCT dib.hadm_id) AS "Obesity_vs_Hypertension_Age_40+", tbl01.age

from tbl01 INNER JOIN mimiciv_hosp.diagnoses_icd dib ON tbl01.subject_id = dib.subject_id

-- 401% relates to hypertension 与高血压有关

WHERE  dib.icd_code LIKE '401%'

AND age > 40

GROUP BY dib.subject_id, tbl01.age

我们来看看代码解释：

这段代码的功能是统计年龄大于40岁且同时患有肥胖症（ICD代码以'278%'开头）和高血压（ICD代码以'401%'开头）的患者记录数。

首先，通过使用两个公共表达式（CTE）agetrbl和tbl01来创建必要的数据集。agetrbl用于计算患者的真实年龄，其中包括患者的相对年龄和入院时间。tbl01则用来筛选出年龄大于40岁且患有肥胖症的患者。

在主查询中，通过将tbl01与诊断表diagnoses_icd连接，筛选出同时患有高血压的患者。最后，利用COUNT(DISTINCT dib.hadm_id)来计算符合条件的患者数量，并按照患者ID和年龄进行分组统计。

WITH agetbl AS: 使用WITH语句创建一个公共表达式（CTE）agetrbl，用于存储计算患者真实年龄所需的数据。
MAX(ROUND(p.anchor_age + mimiciv_derived.DATETIME_DIFF(ad.admittime, mimiciv_derived.DATETIME(p.anchor_year, 1, 1, 0, 0, 0), 'YEAR'),2)) AS age: 计算患者的真实年龄，通过患者的相对年龄、入院时间和偏移年份的差异来计算。
INNER JOIN mimiciv_hosp.patients p ON ad.subject_id = p.subject_id: 通过患者ID将admissions表和patients表进行内连接，以获取患者的信息。
GROUP BY ad.subject_id: 将结果按照患者ID进行分组，以便后续统计每位患者的年龄信息。
tbl01 as (SELECT dia.subject_id, age from mimiciv_hosp.diagnoses_icd dia INNER JOIN agetbl dt ON dia.subject_id = dt.subject_id WHERE dia.icd_code LIKE '278%' AND age > 40 GROUP BY dia.subject_id, dt.age): 创建名为tbl01的临时表，筛选出年龄大于40岁且患有肥胖症的患者信息。
SELECT dib.subject_id, COUNT(DISTINCT dib.hadm_id) AS "Obesity_vs_Hypertension_Age_40+", tbl01.age from tbl01 INNER JOIN mimiciv_hosp.diagnoses_icd dib ON tbl01.subject_id = dib.subject_id: 从临时表tbl01和diagnoses_icd表中选择患者ID、满足条件的患者入院ID数量以及患者年龄信息。
WHERE dib.icd_code LIKE '401%' AND age > 40: 筛选出患有高血压（ICD代码以'401%'开头）且年龄大于40岁的患者。
GROUP BY dib.subject_id, tbl01.age: 将结果按照患者ID和年龄进行分组，以统计符合条件的患者数量。