发布于 2024-05-30 14:39:31

MIMIC-IV数据库如何提取高血压性心脏病的患者信息?

一、MIMIC数据库的subject_id,hadm_id,stay_id

subject_id（患者标识符）：这是用于唯一标识数据库中每个患者的数字标识符。每个患者在数据库中都有一个唯一的subject_id，通过该标识符可以检索与该患者相关的所有信息。（身份证）

hadm_id（医院入院事件标识符）：这是用于唯一标识每次患者进入医院的事件的数字标识符。一个患者可能有多次入院，每次入院都有一个唯一的hadm_id。通过hadm_id，可以检索与特定入院事件相关的信息，如诊断、治疗记录等。（住院号）

stay_id（医院住院事件标识符）：stay_id用于唯一标识患者在医院内的每个连续住院事件。在某些情况下，一个hadm_id可能对应多个stay_id，表示患者在医院期间可能经历了多个不同的住院事件。（进入ICU住院的ICU识别号）

总结一下，通俗来讲，subject_id对应的就是我们的身份证号，每个患者只有唯一一个subject_id，hadm_id对应的就是医院住院号，患者可以每次就诊时注册不同的hadm_id，stay_id是只有患者住院期间入住ICU才有stay_id，每次进入ICU住院stay_id号可以不一样。（患者有且只有一个subject_id，而subject_id可以对应多个hadm_id,也可以对应多个stay_id）

上面这幅图，表示同一个病人（subject_id=16391076）多次住院，每次住院注册了不同的hadm_id，然后住院期间进入了icu使用了不同icu识别符号（stay_id分别有38690181，35392191）。

二、初步筛选出符合某个疾病（高血压性心脏病）诊断的subject_id,hadm_id,stay_id

在mimic_hosp文件夹里面找到d_icd_diagnose表

d_icd_diagnoses表（Diagnosis ICD Codes表）包含有关国际疾病分类（International Classification of Diseases，ICD）的诊断代码的信息。这个表主要用于存储诊断代码及其对应的描述信息。以下是该表包含的一些列（columns）及其解释：

icd_code（ICD代码）：这是国际疾病分类系统中的诊断代码。ICD代码是一种标准化的医学编码系统，用于识别医学诊断和程序。
icd_version（国际诊断编码版本）：主要是icd_code不同的诊断代码版本，在mimic数据库中有9和10版本
long_title（详细标题）：包含ICD代码的详细描述或标题，通常提供更详细的信息，以便更好地理解该诊断。

三、高血压性心脏病

以高血压性心脏病为例，在d_icd_diagnose表中找到符合高血压性心脏病的icd_code,并放work数据库下的d_icd_Hypertensive_heart_disease中

代码解释：

SELECT d.*: 从表 d_icd_diagnoses 中选择所有列（*表示所有列）
from mimiciv_hosp.d_icd_diagnoses d : 从名为 mimiciv_hosp 的数据库中的表 d_icd_diagnoses 中选择数据，并将其别名为 d
WHERE d.long_title LIKE '%Hypertensive heart disease%': 对选定的行进行筛选, 只选择那些 long_title 列中包含字符串 'Hypertensive heart disease' 的行。LIKE 是一个模糊匹配操作符，% 表示任意字符的任意次数。
请大家记住这个用法，LIKE '%Hypertensive heart disease%'表示只要是高血压性心脏病的诊断都能查出来，例如上面代码可以将原发性高血压性心脏病或继发性高血压心脏病或其他原因高血压性心脏病等符合诊断的icd_code查询处理。