发布于 2024-04-18 15:27:32

MIMIC-IV数据库，如何提取哪些肺栓塞病人进行了溶栓手术治疗？

溶栓手术是通过药物或者手术的方式，使闭塞的血管再通的一种手术。
溶栓手术主要是通过药物或者手术的方式，使闭塞的血管再通的一种手术。常用的药物有尿激酶、链激酶等，这些药物可以激活纤溶酶原，使纤溶酶原转化为纤溶酶，从而达到溶栓的目的。而手术治疗主要是通过介入治疗，将导丝、导管等精密器械引入到闭塞的血管部位，通过注射溶栓药物，将血栓溶解，从而达到血管再通的目的。
在日常生活中，患者要注意多休息，避免过度劳累，同时也要避免进行剧烈运动。在饮食上可以适当进食富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、西红柿等，有助于补充身体所需要的营养，从而增强自身的抵抗力。另外，患者还要保持良好的心态，避免情绪激动，以免影响病情的恢复。
溶栓治疗一般是由血栓等原因引起的，可采用药物溶栓、机械溶栓和导管治疗等方式进行治疗，详情如下：
1. 药物溶栓：适用于患者血栓较小、病情不严重或无法接受手术治疗的情况下。药物溶栓是通过静脉注射溶栓药物，如组织型纤溶酶原激活剂（tPA）等，来溶解血栓。此方法适用于急性心肌梗死、肺栓塞等情况。
2. 机械溶栓：适用于血栓较大、血流阻塞严重的情况下。机械溶栓是通过插入导丝和器械到血管内，直接将血栓物理碎裂或取出。常见的机械溶栓方法有血栓抽吸术和血栓切割术等。此方法适用于急性深静脉血栓、动脉血栓等情况。
3. 导管治疗：适用于血栓较大、血流阻塞严重且存在动脉狭窄或闭塞的情况下。导管治疗是通过插入导管到血管内，先行扩张或通畅血管，然后再进行药物溶栓或机械溶栓。此方法适用于急性冠状动脉综合征、急性脑梗死等情况。

1. 我们需要找到肺栓塞病对应的icd_code，这需要从mimiciv_hosp.d_icd_diagnoses表查找

肺栓塞的英文

我们也可以用翻译后的中文表查询，需要翻译后的中文表，关注微信公众号【科研收录】，回复"d_icd_cn"

2. 用对应的icd_code获取对应的患者信息，也就是我们需要从mimiciv_hosp.diagnoses_icd表内查找出subject_id 和 hadm_id ，并和mimiciv.admissions联表查询

diagnoses_icd表：ICD诊断码数据，记录了与患者诊断相关的国际疾病分类（ICD）编码和描述。

subject_id：患者的唯一标识符。
hadm_id：入院号，指患者的住院标识符。
seq_num：诊断顺序号，表示该诊断在所有诊断中的顺序。
icd_code：诊断编码，指诊断的疾病或症状在国际疾病分类（ICD）中的编码。
icd_version：ICD版本，指使用的ICD编码标准版本号。

admissions表：患者入院记录数据，包含有关患者入院的信息，如入院时间、出院时间、诊断等。

subject_id：患者的唯一标识符。
hadm_id：每次住院的唯一标识符。
admittime：入院时间，表示患者被接收为住院患者的日期和时间。
dischtime：出院时间，表示患者从医院出院的日期和时间。
deathtime：死亡时间，如果患者在医院内死亡，则记录死亡日期和时间。
admission_type：入院类型，示患者被接收到医院的方式，如急诊、计划手术等。
admit_provider_id：接收患者的医生或提供护理的医疗专业人员的唯一标识符。
admission_location：入院地点，表示患者被接收到医院的具体位置，如急诊室。
discharge_location：出院地点，表示患者离开医院后的具体位置，如家庭、养老院等。
insurance：患者的医疗保险类型，如医保、商业保险等。
language：患者的语言。
marital_status：患者的婚姻状况。
race：患者的种族或民族。
edregtime：急诊室接收时间，表示患者进入急诊室的日期和时间。
edouttime：急诊室出院时间，表示患者离开急诊室的日期和时间。
hospital_expire_flag：住院期间是否死亡的标志，1表示患者在住院期间死亡，0表示未死亡。

3. 再联表 mimiciv_hosp.patients表获取患者的基本特征，包括死亡时间(dod)或是否发生院内死亡

4. 查找溶栓手术的icd_code, 这也需要从mimiciv_hosp.d_icd_procedures表查找出icd_code，然后在mimiciv_hosp.procedures_icd表查询出subject_id 和 hadm_id

查询手术代码表mimiciv_hosp.d_icd_procedures，找到溶栓所对应的手术icd_code代码

查询mimiciv_hosp.procedures_id表查询溶栓患者的名单（project_id 和 hadm_id）

5. 将溶栓患者与肺栓塞患者内连接即可提取符合肺栓塞与溶栓的病人(通过subject_id 和 hadm_id关联)

!注意要限制溶栓的时间在肺栓塞患者入院与出院时间内

这段代码其实也可以用于提取外科病人是否进行某手术，比如我们想知道诊断为肺癌病人做了肺叶切除术后有多少患者

从上面的数据提取我们能看出来，这类基于MIMIC数据库的研究的主要思路

研究主要思路
这一类研究的主要套路就是：

利用diagnoses_icd(患者在住院期间的所有诊断icd-9代码)中的诊断和顺序(seq_num)从所有重症病人中筛选出一类自己感兴趣的疾病的患者，得到患者的subject_id、hadm_id和icustay_id；
从d_labitems(实验室检查项目字典)和labevents（表示患者住院期间的所有实验室检查结果）中找到自己感兴趣的实验室标志物：采用group、row_number等语句限定患者入院(或进入ICU)的第一次检查结果或特定时间内的检查结果；
从patients中提取出患者的基本特征，包括死亡时间(dod)或是否发生院内死亡；
从icustays中找到患者的出院时间 (dischtime)，结合患者的死亡时间(dod_ssn)计算出随访时间。注意：来源于carevue的病例随访时间最短为4年，来源于metavision中的数据最短随访时间为90天；
从github上找到计算各种严重程度评分的脚本，然后在本地电脑中运行得出各个患者每次住院的疾病评分(比如SOFA、SAPS II、APS III等)，并将这些严重评分纳入最终的统计学分析。

这类研究整体的思路就是：