mimic数据提取 - 话题

白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 10:24:48

MIMIC数据库，如何检索成年患者的收缩压？
从mimiciv_icu.chartevents表获取收缩压 -- 检索成年患者的收缩压 -- Retrieves the systolic blood pressure for adult patients WITH agetbl AS ( ...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 10:58:11

MIMIC数据库，如何提取患者的治疗信息(药物治疗和非药物治疗)?
MIMIC数据库的治疗信息提取，分药物治疗及非药物治疗数据。 MIMIC数据库的治疗信息提取，分药物治疗及非药物治疗数据。会python的同学可以看这篇文章： MIMIC数据库，使用Python研究万古霉素的剂量（一）我们来看看药物治疗的药...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 11:23:21

MIMIC-IV数据库，如何查询脑梗cerebral infarction患者数据?
脑卒中，英文stroke -- 相关疾病信息保存到diseases WITH diseases AS ( -- stroke SELECT icd_code, icd_version, long_title FROM MIMICIV_...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 11:37:17

MIMIC-IV数据库，如何查询实验室指标甘油三脂?
首先，甘油三酯的编号，在 MIMICIV_HOSP.D_LABITEMS 中查找，为51000。 SELECT itemid, label FROM MIMICIV_HOSP.D_LABITEMS WHERE label like '%Triglycer...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 13:49:51

MIMIC-IV数据库，如何提取实验室检查指标（红细胞、白细胞、血小板、血红蛋白浓度）?
红细胞(rbc) 白细胞(wbc) 血小板(plt, platelet) 血红蛋白浓度( HB , hemoglobin) 这几个指标都在 mimiciv_derived.complete_blood_count 表中 SELECT i.subjec...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:13:06

MIMIC-IV数据库，如何提取肝硬化患者信息?
首先，查询肝硬化的诊断 icd-code 。肝硬化：cirrhosis。 -- 相关疾病信息保存到diseases -- 肝硬化患者数量 WITH diseases AS ( -- cirrhosis SELECT icd_code, i...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:27:32

MIMIC-IV数据库，如何提取哪些肺栓塞病人进行了溶栓手术治疗？
溶栓手术是通过药物或者手术的方式，使闭塞的血管再通的一种手术。溶栓手术主要是通过药物或者手术的方式，使闭塞的血管再通的一种手术。常用的药物有尿激酶、链激酶等，这些药物可以激活纤溶酶原，使纤溶酶原转化为纤溶酶，从而达到溶栓的目的。而手术治疗主要是通过介入治疗...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:31:46

MIMIC数据提取教程，如何提取患者入ICU后第一个WBC和SpO2值
阅读本文建议先看这篇，里面有相关sql基础的解释 MIMIC数据提取教程 - 提取患者首次入ICU数据一般情况下，我们也不会关心患者的所有临床指标，我们就再具体一些，比如：如何提取患者入ICU后第一个WBC和SpO2值 WBC: white blood...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:33:06

MIMIC数据库涵盖了哪些临床常见疾病？
数据源： MIMIC-IV数据集 2.2版本其中医院账单信息主要在这些表中(diagnoses_icd,d_icd_diagnoses,procedures_icd,d_icd_procedures,hcpcsevents,d_hcpcs,drgcode...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:34:29

MIMIC数据库中，如何根据不同的目的，来选择合适的药物数据?
MIMIC数据库是一个公开的医疗电子记录数据库，用于研究和开发医学信息处理和机器学习算法。在MIMIC数据库中，有几个与药物相关的表格，包括prescription（处方）、pharmacy（药房）和eMAR（电子医疗管理）表格。下面是它们的主要区别： ...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:35:46

MIMIC-IV数据库如何提取高血压性心脏病的患者信息?
一、MIMIC数据库的subject_id,hadm_id,stay_id subject_id（患者标识符）：这是用于唯一标识数据库中每个患者的数字标识符。每个患者在数据库中都有一个唯一的subject_id，通过该标识符可以检索与该患者相关的所有信...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:37:16

MIMIC数据提取教程 - 提取入住ICU第一天生命体征（血氧饱和度、血压、呼吸、体温）
数据源：mimiciv数据库2.2版本一、MIMIC数据库的subject_id,hadm_id,stay_id subject_id（患者标识符）：这是用于唯一标识数据库中每个患者的数字标识符。（身份证） hadm_id（医院入院事件标识符...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 15:58:10

MIMIC数据提取教程 - 如何提取患者首次入ICU数据
一、提取患者首次入ICU信息思路：患者入ICU信息存储在mimic_icu.icustays表中，intime为患者入ICU的时间。我们的思路是根据患者的subject_id分组（分组SQL我们一般使用：group by 或者 ...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 19:10:15

MIMIC-IV数据库，患者随访时间如何获取？
我们在阅读MIMIC-IV数据库相关SCI论文时候，经常看到这样的以患者28天为随访时间的截断点开展的研究《脓毒症患者血红蛋白与 28 天死亡率的相关性：使用 MIMIC-IV 数据库进行二次数据挖掘》《PaO2/FiO2 与脓毒症患者 28 ...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 19:14:39

MIMIC数据库，如何查询肺栓塞患者是否接受机械通气治疗（如气管插管、气管切开）?
非药物治疗提取数据原则：词典查询定位——SQL代码通式书写——合并——清洗 Ventilation表通过机械通气设备对患者进行呼吸支持，以维持呼吸功能和氧合状态的治疗方法 stay_id: 住院记录ID Starttime: 机械通气治疗开始时...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 19:18:04

MIMIC数据提取教程 - 如何提取患有肥胖症疾病的患者?
有同学问想提取某种疾病患者数据，我们这里以肥胖症obesity为例一、首先获取肥胖症(obesity)相关的icd编码跟Obesity相关的疾病有：24个icd code 以"V"开头的ICD9编码是利用BMI来衡量是否肥胖的。BMI为身体质量指...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 19:20:41

MIMIC数据库，官方代码库中concept_map文件夹主要是用来干什么的？
在MIMIC-IV代码库中 https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/tree/main/mimic-iv/concepts/concept_mapc-code/tree/main/mimic-iv/concepts/co...

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白鲸鱼🐳

发布于2024-04-18 19:23:46

MIMIC-IV数据库如何提取氧疗相关数据?
我们知道氧疗是ICU中的重要治疗手段。所有的氧疗数据都来自chartevents，就是我们的特护单数据。我们要想知道氧疗相关数据，必须知道该疗法对应的itemid itemid:223834,227582表示氧流量新版视图这里删除了一个itemi...

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白鲸鱼🐳
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Figshare平台服务学科多样，以生物学为基础，在Digital Science公司支持下，现已发展为包含生物学在内的将近30多种学科，如医学、地理学、物理学、人文学、天文学等，主要以生物学和医学为主，覆盖整个科学研究领域。平台接受多种格式的科研数据，提供了当前学术出版所不具备的一种文件共享模式。平台给所有对象分配唯一的DOI号，采用Creative Commons许可协议共享数据，大大减少了版权纠纷，可供全球科学家存取、共享信息，并采用基于云的数据管理系统来保证数据存储的安全和可靠性，还为用户提供权限设置的功能，用户自行决定对其科研数据、音频、论文和视频等研究成果是否公开。
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PLOS是一家非营利性的开放获取出版商，通过引领研究交流的变革，使研究人员能够加速科学和医学的进步
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涵盖了20家大型医院2014-2015年间，超过20万名入住重症监护病房患者的住院相关的数据，涉及心内ICU，胸外ICU，内科ICU，神经外科ICU等数据。
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