CTRP癌症治疗反应数据库

访问链接:https://portals.broadinstitute.org/ctrp/

数据库简介:

癌症治疗反应门户(The Cancer Therapeutics Response Portal,CTRP)将癌症细胞系的遗传、谱系和其他细胞特征与小分子敏感性联系起来,目的是加速发现与患者匹配的癌症治疗方法。

这一重要的资源推动发现与患者群体相匹配的潜在癌症药物,使患者最大可能从中受益。CTRP这一门户网站涵盖了70,000个癌细胞系化合物敏感性和遗传或谱系特征之间的联系,作为一个公共资源供世界各地的研究人员所用。研究人员可利用这一数据集来寻找不同癌症类型可供利用的治疗脆弱点。

研究人员生成了一个481个小分子探针和药物的信息集,这些探针和药物选择性地瞄准细胞回路中的不同节点,并共同调节广泛的细胞过程。研究人员定量测量了860个深具特征的癌细胞系对告密化合物的敏感性,并进行了与癌症特征相关的敏感性分析,包括突变、基因表达、拷贝数变异和谱系。这些分析以及到底层数据的链接都是在CTRP上公开提供的。

CTRP包含信息中的这些细胞系来自许多不同种类的肿瘤,另一项称作为癌细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互补研究已经确定了这些细胞系的基因组特征。在美国国家癌症研究所癌症靶点发现和开发(CTD2)项目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共数据,其中包含了有关每个癌细胞系突变、基因表达和其他基因组改变的信息。

CTRP是生物医学研究界的一个活资源,可以开发出对小分子作用机制和新的治疗假设的见解,并支持未来根据预测性生物标记物发现与患者匹配的药物。

 

参考资料:

 

An Interactive Resource to Identify Cancer Genetic and Lineage Dependencies Targeted by Small Molecules

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867413009604